Genoma del algarrobo (Neltuma pallida)

AED: Annotation Edit Distance (0 - 1), valores más cercanos a 0 describen modelos de genes más confiables.

GOs: Términos de Ontología de Genes, vocabulario de clasificación de genes y proteínas según su actividad bioquímica, procesos biológicos y ubicación física.

PFAM: Base de datos de dominios proteicos.

OGs: Grupos ortólogos según eggNOG-mapper usados para la anotación.

KEGG: Enciclopedia de genes y genomas de Kyoto, colección de bases de datos de rutas enzimáticas.

COG: Cluster Orthologous Genes, clasificación de genes en grupos funcionales:

• J - Traducción, biogénesis y estructura ribosómica

• A - Procesamiento y modificación de ARN

• K - Transcripción

• L - Replicación, recombinación y reparación

• B - Estructura y dinámica de cromatina

• D - Control del ciclo celular, división celular, particionamiento cromosómico

• Y - Estructura nuclear

• V - Mecanismos de defensa

• T - Mecanismos de transducción de señales

• M - Biogénesis de pared celular/membrana/envoltura

• N - Motilidad celular

• Z - Citoesqueleto

• W - Estructuras extracelulares

• U - Tráfico intraceular, secreción y transporte vesicular

• O - Modificación postraduccional, recambiod e proteínas, chaperonas

• X - NAN

• C - Producción y conversión de energía

• G - Metabolismo y transporte de carbohidratos

• E - Metabolismo y transporte de aminoácidos

• F - Metabolismo y transporte de nucleótidos

• H - Metabolismo y transporte de coenzimas

• I - Metabolismo y transporte de lípidos

• P - Metabolismo y transporte de iones inorgánicos

• Q - Biosíntesis, transporte y catabolismo de metabolitos secundarios

• R - Solo predicción funcional general

• S - Función desconocida

QI: Resumen de índices de calidad de Maker:

• QI1: Longitud del 5' UTR

• QI2: Fracción de sitios de empalme confirmados por un transcripto secuenciado

• QI3: Fracción de exones cubiertos por un transcripto secuenciado

• QI4: Fracción de exones cubiertos por un transcripto secuenciado o un alineamiento de proteína de la base de datos

• QI5: Fracción de sitios de empalme confirmados por una predicción ab initio

• QI6: Fracción de exones cubiertos por una predicción ab initio

• QI7: Número de exones en el ARN mensajero

• QI8: Longitud del 3' UTR

• QI9: Longitud de la secuencia proteica producida por el ARN mensajero